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本系列圖書以三個最古老的微生物——古菌穿越大氣層來到地球作為故事開端,帶着古老的身世之謎和小讀者一起探索地球上的微生物。《細菌視界——出擊!身體保衛戰》作為本系列的第二部作品,劇情緊接第一部,描述三位主人公離開海洋和森林到達人類社會,為幫助小女孩化解病癥而在她身體各個器官中與各種微生物(如大腸桿菌、腦膜炎奈瑟菌)鬥爭的故事,讓小讀者在歷險故事中了解微生物知識。