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首先，“書系”包含五個系列，即甲種專著、乙種論集、丙種譯叢、丁種資料、戊種公共史學，這顯示了我們對六朝歷史之基礎研究與應用研究的全面關注、對話學界之“學院”史學與面向社會之“公共史學”的相容並包。
其次，“書系”出版採取“1+N”模式，“1”為南京大學出版社，“N”為其他出版社，“1”為主，“N”為輔，但仍按出版時序進行統一編號。所以如此處理，自然不在追求“差異美”，而是隨順作者、譯者、編者的意願以及其他各別複雜情形。
再次，“書系”雖以“南京大學六朝研究所書系”冠名，但只是冠名而已，我們會熱忱邀約、真誠接受所內外、校內外、國內外的書稿，並盡遴選、評審、建議乃至修改之責。
要之，五個系列的齊頭並進、出版單位的靈活安排、書稿來源的不拘內外，這樣有異尋常的總體設計，又都服務於我們的相關中期乃至遠期目標：通過若干年的努力，使學界同仁共襄盛舉的“南京大學六朝研究所書系”漸具規模、形成特色、產生影響，而“南京大學六朝研究所”也因之成為學界同仁信任、首肯乃至讚譽的研究機構。如此，庶不辜負我們回望的如夢的六朝時代、我們生活的堅韌而光榮的華夏正統古都南京、我們工作的誠樸雄偉勵學敦行的南京大學、我們鍾情的昌明國粹融化新知的南京大學歷史學院。
總序
原序（1992）
上篇 建康城
建康與六朝歷史的發展
六朝建康城的興盛與衰落
六朝建康的經濟基礎
六朝建康的佛寺與城市空間
六朝建康的園宅
六朝時代的建康——市廛、民居與治安
東晉南朝“鐘山文化區”的形成
六朝建康與北魏洛陽之比較
中篇 社會與經濟
移民潮、非漢民族和六朝商業政策的轉變
三至六世紀浙東地區的經濟發展
六朝會稽士族
六朝南海貿易的開展
下篇 中古都城坊制
魏晉北朝的築城運動
中古都城坊制初探
中古都城坊制的崩解
後記（增訂本）
