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《路易斯與奈比雅》從歐洲遠道而來的少年路易斯和女僕奈比雅兩個人，為了得到「和算一關流」的密法，而接近一關流的使用者佐藤玲。玲總覺得誓言服從路易斯的奈比雅身上，有種奇怪的不協調感，因此，他即使遭到青梅竹馬的表妹鈴音凜誤會，仍決定查出奈比雅的秘密。就在這時，追著路易斯和奈比雅而來的危險組織「薔薇十字團」也現身了……。算法的祕術是否能夠挽救真愛呢？
