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本書介紹了單細胞測序的操作方法，以及其在微生物學、系統免疫學、轉錄組學、生物資訊學、基礎醫學、臨床醫學中特別是呼吸內科，腫瘤科等學科中的具體應用，內容包括方法設計、重複性驗證及應用經驗。重點突出了單細胞技術在疾病機制研究中的應用潛力，指出探索單細胞生物學功能、表觀遺傳學、代謝學及其基因與蛋白網路系統等的基本路徑。本書可供與腫瘤相關專科的臨床醫生，免疫學、微生物學、基因組學、轉化醫學專業人員和研究生閱讀參考。
王向東
復旦大學特聘教授、復旦大學附屬中山醫院呼吸科特聘教授、博士生導師。上海市臨床生物資訊學研究所所長，上海市呼吸病研究所副所長，瑞典隆德大學臨床生物資訊學兼職教授、英國倫敦國王學院呼吸醫學兼職教授。兼任國際轉化醫學學會副主席、中國醫師協會資深顧問、中國醫師協會醫師健康管理與保險專業委員會副主任委員。
第1章 單細胞測序在未來醫學中的應用
一、單細胞研究
二、單細胞測序的臨床應用意義
三、基本操作流程
四、與傳統的基因晶片技術方法的比較
五、機遇與挑戰
六、小結
第2章 超級細胞模型在單細胞表型分類中的應用
一、超級細胞模型及其發展
二、單細胞研究面臨的挑戰
三、超級細胞模型
四、實例解析：超級細胞模型在單細胞轉錄組測序中的應用
五、小結
第3章 微生物單細胞基因組分析
一、微生物與非可培養微生物類群
二、單細胞基因組分析的基本方法
三、全基因組擴增的技術方法
四、單細胞全基因組測序應用于不可培養微生物的研究
五、小結
第4章 單細胞測序在動態轉錄組中的應用
一、單細胞轉錄組動態分析的應用價值
二、單細胞轉錄組測序的基本原理和步驟
三、用於單細胞測序的微流體裝置的開發
四、RNA測序方法的基本步驟
五、已發表的單細胞RNA測序方法及比較
六、分析單細胞轉錄組資料中的生物資訊學挑戰
七、單細胞RNA測序的應用
八、小結
第5章 系統免疫學在樹突狀細胞代謝研究中的應用
一、系統免疫學簡介
二、樹突狀細胞代謝調控的研究進展
三、DC代謝調控中的系統免疫學
四、展望
第6章 系統免疫學及調節性T淋巴細胞研究
一、調節性T細胞概述
二、系統生物學技術在Treg領域的應用
三、展望
第7章 幼淋巴細胞-淋巴細胞與生物資訊學
一、幼淋巴細胞特性
二、幼淋巴細胞的蛋白組學
三、幼淋巴細胞的基因組學
四、幼淋巴細胞與白血病
五、白血病特異性生物標誌物
六、展望
第8章 淋巴細胞在肝癌中的作用及其治療利用
一、肝癌及其發病機制研究進展
二、肝癌中的TIL亞群
三、基於TIL的肝癌治療
四、採用高通量技術研究肝癌淋巴細胞
五、肝癌中的網路化調控和個體化治療
六、小結
第9章 肝細胞壞死的早期生物標誌物
一、肝細胞死亡
二、凋亡和壞死生物標誌物
三、微小核糖核苷酸（microRNA）
四、線粒體損傷生物標誌物
五、炎症生物標誌物
六、DNA損傷生物標誌物
七、小結
第10章 基於流式細胞儀的單個細胞分選實驗步驟
一、單細胞的流式細胞儀分選
二、實驗步驟
三、小結
第11章 分離肺癌單細胞
一、單細胞技術和組學科學
二、單細胞分離技術
三、口吸管顯微操作試驗方案
四、小結
第12章 腫瘤生物資訊學
第13章 單細胞異質性檢測在腫瘤中的應用
一、單細胞異質性在腫瘤診斷及治療中的臨床意義
二、單細胞異質性的檢測對象
三、單細胞異質性檢測方法
四、小結
參考文獻
