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噬菌體是細菌特異性病毒，也是潛在的活體藥物，必將在防治細菌感染和污染中發揮重要作用，亟待開展藥理學研究和規範。本書以噬菌體藥理學為主線，串聯噬菌體分離、生物學性質、噬菌體-宿主相互作用、噬菌體評價方法、生物資訊學、噬菌體應用的技術方法。本書將對提高動物保護、植物保護、畜牧業、農業和食品行業人員的噬菌體研發和應用能力，實施減抗降抗，控制細菌等發揮積極作用。本書適用於從事細菌生物技術研究的技術人員。
緒論：噬菌體群體治療藥理學方法和框架1
第1部分 基礎噬菌體學23
1水和土壤中噬菌體的富集25
2環境樣品中噬菌體的分離方法31
3溶原誘導法分離噬菌體39
4氯化鐵絮凝回收海水中的噬菌體46
5陰離子交換色譜法純化噬菌體52
6噬菌體計數——雙層平板法60
7噬菌體計數——直接塗板法66
8噬菌體的計數——微量滴定板法69
9噬菌體的電鏡觀察72
10噬菌體宿主範圍和裂解率的測定82
11噬菌體對細胞吸附率的測定88
12一步生長曲線測定92
13利用純化受體測定噬菌體的失活動力學97
14噬菌體突變株的構建100
15裂解性噬菌體的普遍性轉導110
16噬菌體的高通量篩選119
17家蠶幼蟲模型在噬菌體治療實驗中的應用123
18大蠟螟幼蟲替代動物作為感染模型分析病原菌致病力的應用130
19果蠅感染模型和評價噬菌體 效果的應用137
20浮萍和紫苜蓿作為細菌感染模型系統的應用143
21雞胚致死試驗評估噬菌體治療效果的應用149
22噬菌體-生物膜相互作用的評價技術154
23使用噬菌體FISH法檢測單細胞水準的噬菌體感染161
24酶譜分析噬菌體裂解蛋白的肽聚糖水解活性177
25即食食品中噬菌體效果的定量測定183
第2部分 噬菌體生物資訊學189
26噬菌體的分類與命名191
27病毒組研究方法194
28常見細菌的噬菌體201
29噬菌體研究的網路資源219
30噬菌體表徵的必要步驟：生物學、分類學和基因組分析224
31使用RAST對噬菌體基因組注釋238
32噬菌體基因組資料的視覺化分析：比較基因組學和作圖244
33噬菌體裂解物的製備和DNA純化260
34脈衝場凝膠電泳（PFGE）測定噬菌體基因組大小266
35噬菌體基因組末端的高通量測序分析271
36通過分析有尾噬菌體基因組的末端確定DNA包裝策略290
37來自單一噬菌斑的雙鏈DNA噬菌體的基因組測序304
38利用感染裂解性噬菌體的細胞構建cDNA文庫以使用RNA-Seq進行轉錄組分析308
39螢光定量PCR測定宿主菌和噬菌體mRNA的表達315
40噬菌體的純化以及噬菌體結構蛋白的SDS-PAGE分析324
41噬菌體蛋白質組學：質譜的應用332
第3部分 噬菌體應用341
42噬菌體治療343
43使用Strep-tagⅡ純化分析噬菌體-宿主的蛋白質-蛋白質相互作用349
44用於分枝桿菌藥物敏感性試驗的螢光桿菌噬菌體363
45工程噬菌體生物感測器370
46將噬菌體基因組導入大腸埃希菌的電穿孔法379
47枯草芽孢桿菌噬菌體SPO1的定點突變384
48電穿孔DNA噬菌體重組技術（BRED）在裂解性噬菌體基因操作中的應用391
49用親和層析法分離競爭性噬菌體修飾展示的T4噬菌體401
50用於檢測和生物防控的噬菌體及其蛋白質的固定化407
51銅綠假單胞菌噬菌體中編碼生長抑制性ORFan的篩選420
52噬菌體展示技術432
