共12卷,分草、木、谷、菜、果、金、石、水、火、土、獸、禽、鱗、介、蟲、人、服用17部,載藥896種,其中正名697種,附藥199種。每藥首錄性味陰陽、有毒無毒、產地、生藥形態、歸經、相使、相惡、禁忌、炮制等內容;次述功效、主治;末為按語,闡述治病機理、配伍應用及用藥宜忌等。
卷之一
草部
人參
黃芪
白術
蒼術
當歸
甘草
生地黃
熟地黃
天門冬
麥門冬
牡丹皮
何首烏
遠志
川芎附:馬銜、京芎、台芎、撫芎
芍藥附:赤芍藥、白芍藥
五味子
石菖蒲
續斷
蒺藜附:白蒺藜、刺蒺藜
石斛
牛膝
香附子
附子附:烏頭、烏頭附子尖
天雄
肉蓯蓉
巴戟天
胡蘆巴
瑣陽
覆盆子
仙茅
淫羊藿
菟絲子
蛇床子
狗脊
益母子
黃精
卷之二
草部
……
卷之三
卷之四
卷之五
卷之六
卷之七
卷之八
卷之九
卷之十
卷之十一
卷之十二