桐人進入這個神秘的幻想世界已經兩年了。他與好友尤吉歐在「北聖托利亞帝立修劍學院」成為了「上級修劍士」,以人界最強的秩序執行者「整合騎士」為目標,過著勤奮修行的日子。兩人在成為上級修劍士後,身邊各自多出了一個侍從。桐人的侍從叫羅妮耶,尤吉歐的侍從叫蒂潔。
四個人結下了深厚的友誼,過著充實的修士生活,然而就在此時——「惡意」突然降臨了。羅妮耶和蒂潔被卑劣的貴族們所陷害,目睹了這件事的尤吉歐想要對他們拔劍相向,身體卻因為對教會的信仰而無法動彈。就在此時,尤吉歐的右眼傳來一陣劇痛,浮現出了奇怪的符號。那是一串尤吉歐無法解讀的神聖文字。——「SYSTEM ALERT」。