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前言 005
第一章 傳統進化論中有爭議的問題 011
第一節 果殼裡的進化論 011
第二節 生命重要還是繁殖重要？ 013
第三節 基因決定一切嗎？ 029
第四節 衰老是必然的嗎？ 035
第五節 做夢的原因？ 040
第二章 進化生物學說…… 042
第一節 達爾文的進化論 042
第二節 進化論的先驅──拉馬克 053
第三節 拉馬克的進化論 056
第三章 進化現場的灰衣人 085
第一節 進化有方向嗎？ 085
第二節 有方向的進化，誰在把握方向？ 094
第三節 看不見的進化之手 098
第四節 進化的速度 103
第五節 適應性突變 105
第六節 進化是漸進還是躍進？ 110
第七節 進化是隨機突變加自然選擇嗎？ 120
第八節 中性學說 133
第九節 有害基因的用處 140
第十節 生物的自主 145
第十一節 複雜的凝血過程 148
第十二節 天性怎麼遺傳的？ 152
第四章 基因的重要性，但不是決定性 158
第一節 基因 158
第二節 基因的修復機制 175
第三節 道金斯教授 179
第四節 自然選擇的基本單位 181
第五節 基因需要合作麼 184
第六節 基因的產生 185
第七節 植物的產生 190
第八節 奇怪的有性生殖 194
第九節 不那麼自私的基因 197
第十節 是誰在控制基因？ 201
第十一節 拉馬克理論的曙光：表觀遺傳學 202
第五章 任何生物都有智慧嗎？ 216
第一節 什麼是意識？ 216
第二節 動物是否有意識？ 225
第三節 簡單動物的智慧 261
第四節 細菌的智慧 269
第五節 蛋白質的智慧 302
第六節 意識到底是什麼 324
第六章 智慧是什麼 338
第一節 內因和外因 338
第二節 神秘的灰衣人 355
第三節 生物智慧的三層結構 361
第四節 暗物質和暗能量 368
第五節 只有地球適合生物生存？ 371
第六節 暗生物來了 377
第七章 暗生物是什麼 382
第一節 笛卡爾的二元論 382
第二節 電腦程式和生物智慧 389
第三節 生物的共生 393
第四節 奇葩的共生 403
第五節 暗生物的注入 405
第六節 共生的條件 408
第七節 器官移植的條件 410
第八節 暗生物和生物體共生在一起 411
第八章 暗生物的組成 419
第一節 暗生物的三層組成部分 419
第二節 潛意識和意識 421
第三節 潛意識和意識的由來 448
第四節 暗生物和中醫 454
第五節 暗生物和「場」 470
第六節 每個細胞都有自己的暗生物 473
第七節 暗生物的成長 474
第九章 謎底揭曉 482
第一節 出現生命 482
第二節 基因之外，暗生物也有記憶功能 489
第三節 繁殖重要的原因 492
第四節 衰老和死亡的原因 496
第五節 寶貴的生命 519
第六節 同性戀的原因 521
第七節 做夢的原因 526
第八節 從暗生物的角度來解決其他問題 533
第九節 生命的意義 541
第十節 證偽暗生物理論 555
