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故事發生在不久的將來，此時超能力者的存在成為理所當然的事實，但是他們與普通人之間的裂痕卻未完全弭平。天才科學家?皆本光一致力促成雙方建立友好關係，然而史上最邪惡的超能力犯罪者兵部京介，卻出現在他以及最強超能力者「超能少女組」面前!!在不遠的未來，普通人與超能力者將爆發一場最後的戰役，兵部京介會成為其中的關鍵人物嗎…!?隨著新角色加入，劇情急速進展的超能力少女養成喜劇第３集登場!!
