我要向全世界的神奇寶貝宣佈!世界第一的神奇寶貝專家…就是我!」小智這樣大聲宣佈著,他是來自真新鎮的十歲少年,他正與最先得到的神奇寶貝-皮卡丘一同在修行的旅程中。途中他與原本是尼比練功場的首領-小剛,以及同樣在修行,非常喜歡水系神奇寶貝的小霞相遇,並且一起結伴繼續朝著修行之旅邁進。
正當小智一行人在某個深山裡迷路時,無意間發現了淺紅練功場。在宛如忍者屋的練功場裡,小智和使用毒系神奇寶貝的練功場首領-阿桔交過手後,贏得了勝利,第六個粉紅徽章也終於到手了!
後來,他們遇見了傳說中的迷你龍,也參加了神奇寶貝大賽跑的比賽,雖然捲入了一場場的麻煩之中,但小智一行人最後還是平安地離開了野生原野區,繼續向單車路邁難……