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座機被擊落的小零與琉亞,在某座島上停留了一陣子之後,被某人救出。而且來解救兩人的人告訴小零在帛琉還有另一架零觀。小零為了借用那架零觀而前往零觀所停留的祕密基地,沒想到零觀的所有人認識小零的父親!在此同時,伊芙也突然現身,並且把琉亞帶走了!